肿瘤相关数据库有哪些，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

来源：整理时间：2024-06-27 10:52:03 编辑：黑码技术手机版

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1，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢
2，关于TCGA数据库的问题新手求助
3，利用springer Link数据库检索有关原发性肝癌的文献
4，中英文医学文献检索的数据库各有哪些
5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

1，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

好像还没有这样的数据库。癌症比较复杂，microRNA在癌症中的表达谱差别比较大，各阶段、各类型、甚至个体之间也有差别，结论也不完全统一。可以查一下最近microRNA相关的综述,可能会有比较全的介绍

怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

2，关于TCGA数据库的问题新手求助

这种东西是看不出来是否判断与肿瘤有关的，肿瘤本身具有远端转移特性，从各个组织中都有可能存在。所以如果想要看pathway是否与肿瘤相关，就需要点进去查看相关文献，把各种蛋白摸透，才能够搞定，如果仅仅凭借go数据库的pathway来的就能判断了

关于TCGA数据库的问题新手求助

3，利用springer Link数据库检索有关原发性肝癌的文献

三大文献检索数据库是以下三个：　　1、SCI(科学引文索引 )：(Science Citation Index, SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、生物、兽医学、工程技术等方面的综合性检索刊物。　　2、EI(工程索引 )：(EngineeringIndex，EI),1884年创刊，由美国工程信息公司出版，报道工程技术各学科的期刊、会议论文、科技报告等文献。　　3、ISTP(科技会议录索引 ) 是世界著名的三大科技文献检索系统，(Index to Scientific & TechnicalProceedings，ISTP)，也是由ISI出版，1978年创刊，报导世界上每年召开的科技会议的会议论文。

利用springer Link数据库检索有关原发性肝癌的文献

4，中英文医学文献检索的数据库各有哪些

常见的英文医学检索数据库：1、Medline——bai世界上最著名的医学文献检索系统之一2、AIDS Databases——有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库3、CANCERLIT——癌症数据库(National Cancer Institute)4、CHID online——综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息5、ClinicalTrials.gov——向医患人员提供的临床实验信息数据库6、DIRLINE——收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息7、药物信息库——包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息8、HSTAT——包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库9、NCCAM Resources——补充和替代医学资源常见的中文医学检索数据库：1、中国知网——知网，是国家知识基础设施的概念。2、生物医学文献数据库——中国医科院信息研究所研制，综合性生物医学数据库，国内权威。3、中国科学引文索引数据库——收集我国出版315种重要期刊，91-94年13万篇论文及45万引文摘要。4、中医中药数据库——中国科学院科学数据库提供5、中国中医药文献检索中心——由中国中医研究院信息中心制作，提供中医药方面的Web界面文献检

CNKI中国知网维普中文科技期刊全文数据库超星数字图书馆读秀学术搜索高等学校中英文图书数字化国际合作计划 CADAL万方数据资源

5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

这里有一个软件：miRTarBae，不错！它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA，即可找到验证了的靶基因。靶基因在Wikipedia就可找到它的功能！目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3（Suppressor of cytokine signaling 3）

1、starbase一个高通量实验数据clip-seq（或称为hits-clip,par-clip,iclip）和mrna降解组测序数据支持的microrna靶标数据库,包含了mirna-mrna，mirna-lncrna，mirna-circrna，mirna-cerna 和rna-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间：2013年11月。2、mirbase众所周知的microrna基因注释数据库。目前mirbase只提供了microrna的靶标的预测软件的链接（如：pictar）。最新版本发布时间：2010年9月。3、chipbase整合clip-seq和chip-seq的数据探讨microrna的转录和转录后调控，构建转录因子->microrna->靶标的调控网络。最新版本发布时间：2012年11月。4、tarbase一个收集已被实验验证的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2009年1月。5、mirecords一个整合的microrna靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间：2010年11月。6、targetscan基于靶mrna序列的进化保守等特征搜寻动物的microrna靶基因。是预测microrna靶标假阳性率较低的软件。而且是microrna领域大牛bartel实验室开发的。最新版本发布时间：2009年4月。7、pictar基于microrna或microrna靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microrna靶基因。假阳性率也较低。是microrna领域大牛rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间：2007年3月。8、pita基于靶位点的可接性和自由能预测microrna的靶标。是著名的生物信息学家segal实验室开发的。最新版本发布时间：2008年8月。9、rna22基于序列特征预测microrna的结合位点。是几个流行的microrna靶标预测软件的其中一个。ibm公司的研究团队开发的。最新版本发布时间：2007年。10、miranda和microrna.org是著名的memorialsloan-kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miranda的最新版本又叫mirsvr。最新版本发布时间：2010年8月。11、microcosmembl-ebi的enright 实验室开发的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2010年8月。12、mirtarbase整合实验证实的microrna靶标的数据库。最新版本发布时间：2010年10月。13、mirgator v2.0整合microrna表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间：2010年11月。14、mirnamap动物的microrna基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间：2008年1月。15、mirdb动物microrna靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间：2010年8月。16、rnahybrid一个基于mirna-target配对自由能预测microrna的靶标。最新版本发布时间：2011年6月。17、mirgenmicrorna基因和microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2007年1月。