如何知道基因组上传到哪个数据库，求玉米GRMZM2G055768 基因序列怎么查到那个数据库

来源：整理时间：2024-07-22 05:00:23 编辑：黑码技术手机版

本文目录一览

1，求玉米GRMZM2G055768 基因序列怎么查到那个数据库
2，如何查基因组
3，如果我已经拿到基因序列那怎么从序列中知道
4，怎样将全基因组序列提交到NCBI上
5，怎么找基因序列

1，求玉米GRMZM2G055768 基因序列怎么查到那个数据库

你到maizegdb.org，在左边输入你的这个代号，就可以得到该基因所有信息了，包括在染色体上的位置，序列等等

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2，如何查基因组

很多物种都有其单独的基因组数据库网站，如斑马鱼。你可以google下，如zebrafish genome database，可以找到ZFIN还有，一般NCBI里面会收录已经测序的基因组

如何查基因组

3，如果我已经拿到基因序列那怎么从序列中知道

一个就是你直接blast 蛋白序列，找到与你的所需要的那个基因的序列另外就是直接search那个肽链的名字如胸腺肽Thymosin，就会出来结果，找到Homo sapiens，打开就会有一条肽链，看看是不是你需要的，那上面有一个CDS

如果我已经拿到基因序列那怎么从序列中知道

4，怎样将全基因组序列提交到NCBI上

有序列提交工具.那个应该可以吧不过全基因组应该可以和NCBI工作人员联系一下,因为数据量比较大给他们发个邮件问下

宏基因组学（metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的dna,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。其主要含义是：对特定环境中全部微生物的总dna（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rdna数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。

5，怎么找基因序列

我一般是在NCBI上面找，世界上有三个大的数据库，NCBI是其中一个，美国的，这个我觉得是最好的。在上边查找基因序列方法是：首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入你要的基因序列名称，点击search就行。然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找你要的基因序列就行了。注意的是，要确定你的基因名称是否是统一的，我以前就是找一个基因费了很多事，之后发现是自己没有用通用的。找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因为结果中会显示该基因的蛋白序列。你也可以在开始search的时候选protein，找到的就是蛋白序列了。多尝试就好了，其实很简单，英文不错的话，更简单。要有耐心。只要已经测过序的基因上边都有，而且这是最全的基因库。其他的不用考虑，找不到就只能考虑上边本人的经验。