geo数据库哪些疾病，GEO数据分析中不同platform可以一起分析吗

来源：整理时间：2024-08-07 18:51:19 编辑：黑码技术手机版

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1，GEO数据分析中不同platform可以一起分析吗
2，哪些遗传病目前可检测
3，GEO数据分析出现问题求教
4，如何对GEO数据库中已有的数据进行分析
5，如何分析GEO数据库中某一疾病的差异基因

1，GEO数据分析中不同platform可以一起分析吗

不行只有一类可以当出现变量时。取定值就可以。

现在想从别人的芯片数据中找一些感兴趣的基因来做，不知道应该如何着手，是否可行。从geo中下载了cel格式的文件，是否应该用这些数据来进行分析，搜了一下看到说可以用r语言来进行分析。分析的过程复杂吗，需要的时间多吗？

GEO数据分析中不同platform可以一起分析吗

2，哪些遗传病目前可检测

这个太多了。在佳学基因《人的基因序列与人体疾病表征》数据库里，可以检测分析的疾病有一万多种，还有很多遗传病没有给名字。实际上佳学基因通过序列分析确定病因，有没有名字已经不重要了。通过基因序列可以直指疾病根源，根据发病原因设计治疗方案。

可以在您怀孕期间检测出您的胎儿是否有遗传病。

哪些遗传病目前可检测

3，GEO数据分析出现问题求教

具体问题具体分析，GEO数据整理，是不是发现不是gene symbol，而是其他ID

现在想从别人的芯片数据中找一些感兴趣的基因来做，不知道应该如何着手，是否可行。从geo中下载了cel格式的文件，是否应该用这些数据来进行分析，搜了一下看到说可以用r语言来进行分析。分析的过程复杂吗，需要的时间多吗?

GEO数据分析出现问题求教

4，如何对GEO数据库中已有的数据进行分析

假设这组数据在A1:A100这个区域，公式：=INDEX(A:A,INT(RAND()*100)+1)或者：=OFFSET(A1,INT(RAND()*100),)

差异表达基因的筛选（阀值）以及后面的生物信息分析都可以做的。差异表达基因筛选步骤：选择geo数据——下载芯片数据——差异分析（方法有很多：sam法，r包处理，t-test检验等）——选择想要的阈值（fold change >4)

5，如何分析GEO数据库中某一疾病的差异基因

除了文献以外，也可以考虑OMIM数据库omim这个数据库的宗旨就是收集疾病及其相关基因的信息的。不过可能存在的问题就是对于疾病的划分比较系统详尽，不是说输入个糖尿病就直接出来一个列表，它对疾病进行了更进一步的分类，需要你仔细看一看，而且对于疾病的描述是很详尽的，不只是简单一个列表，需要你仔细读完，然后才能了解到底有什么相关基因。不过好处就是相当于简化了你找综述得步骤，而且相对比较全面。

如下：probeset_id gsm174883.cel gsm174884.cel gsm174885.cel gsm174886.celaffx-biob-5_at 8.22 7.79 7.14 7.26affx-biob-m_at 7.53 7 6.36 6.63affx-biob-3_at 7.96 7.73 6.92 7affx-bioc-5_at 8.94 8.79 8.04 8.18affx-bioc-3_at 9.01 8.79 7.99 8.17