关于肿瘤的数据库有哪些，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

来源：整理时间：2025-01-20 10:26:23 编辑：黑码技术手机版

本文目录一览

1，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢
2，国内的细胞库有哪些
3，癌症基因信息数据库有什么用
4，有没有可以查询肿瘤中基因突变的数据库
5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

1，怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

好像还没有这样的数据库。癌症比较复杂，microRNA在癌症中的表达谱差别比较大，各阶段、各类型、甚至个体之间也有差别，结论也不完全统一。可以查一下最近microRNA相关的综述,可能会有比较全的介绍

怎么查各种癌组织的microRNA数据有什么数据库可以推荐啊谢谢

2，国内的细胞库有哪些

北京的细胞库中基础所种类比较多，年头比较久，我师兄到那里买过。要是买肿瘤细胞的话最好去肿瘤研究所，那里有个肿瘤细胞库，您查肿瘤细胞库就可以查到。

中科院的细胞库，武汉细胞库，国外的有atcc，醉醉权威的

国内的细胞库有哪些

3，癌症基因信息数据库有什么用

深圳市盛景基因医疗的癌症基因信息数据库可以创建有统计意义的中国人中常见癌症变异与效果基线

通过肿瘤驱动基因查肿瘤原因和风险是佳学基因的专利技术。佳学基因提供所有种类的肿瘤风险评估、肿瘤分子病理分析和肿瘤精准用药治疗。

癌症基因信息数据库有什么用

4，有没有可以查询肿瘤中基因突变的数据库

这个在《佳学基因人体基因序列与疾病表征数据库》里的有，这个是佳学基因特有的数据库，运用的是基因解码技术，这也是为什么一般基因检测无法达到基因解码的精准度与全面性的原因。

基因突变并不代表就是致病的基因突变，看你做什么基因检测，一般肿瘤患者做的基因检测，基本上都是用药指导的基因检测，看是否适合吃这类药物，有没有效果

5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

这里有一个软件：miRTarBae，不错！它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA，即可找到验证了的靶基因。靶基因在Wikipedia就可找到它的功能！目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3（Suppressor of cytokine signaling 3）

1、starbase一个高通量实验数据clip-seq（或称为hits-clip,par-clip,iclip）和mrna降解组测序数据支持的microrna靶标数据库,包含了mirna-mrna，mirna-lncrna，mirna-circrna，mirna-cerna 和rna-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间：2013年11月。2、mirbase众所周知的microrna基因注释数据库。目前mirbase只提供了microrna的靶标的预测软件的链接（如：pictar）。最新版本发布时间：2010年9月。3、chipbase整合clip-seq和chip-seq的数据探讨microrna的转录和转录后调控，构建转录因子->microrna->靶标的调控网络。最新版本发布时间：2012年11月。4、tarbase一个收集已被实验验证的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2009年1月。5、mirecords一个整合的microrna靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间：2010年11月。6、targetscan基于靶mrna序列的进化保守等特征搜寻动物的microrna靶基因。是预测microrna靶标假阳性率较低的软件。而且是microrna领域大牛bartel实验室开发的。最新版本发布时间：2009年4月。7、pictar基于microrna或microrna靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microrna靶基因。假阳性率也较低。是microrna领域大牛rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间：2007年3月。8、pita基于靶位点的可接性和自由能预测microrna的靶标。是著名的生物信息学家segal实验室开发的。最新版本发布时间：2008年8月。9、rna22基于序列特征预测microrna的结合位点。是几个流行的microrna靶标预测软件的其中一个。ibm公司的研究团队开发的。最新版本发布时间：2007年。10、miranda和microrna.org是著名的memorialsloan-kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miranda的最新版本又叫mirsvr。最新版本发布时间：2010年8月。11、microcosmembl-ebi的enright 实验室开发的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2010年8月。12、mirtarbase整合实验证实的microrna靶标的数据库。最新版本发布时间：2010年10月。13、mirgator v2.0整合microrna表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间：2010年11月。14、mirnamap动物的microrna基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间：2008年1月。15、mirdb动物microrna靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间：2010年8月。16、rnahybrid一个基于mirna-target配对自由能预测microrna的靶标。最新版本发布时间：2011年6月。17、mirgenmicrorna基因和microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2007年1月。