疾病靶点数据库有哪些，如何查询某一靶点在不同组织肿瘤中的分布

来源：整理时间：2024-07-09 13:38:48 编辑：黑码技术手机版

1，如何查询某一靶点在不同组织肿瘤中的分布

是不是就像那军队中练设计的靶子，在这里可能是给切除定位的意思吧

如果是蛋白类靶点，组织分布，就是应用免疫组化法，根据染色结果分析。

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2，dialog系统与医学相关的数据库有哪些

你说呢...

DIALOG系统是当今世界上最大的联机检索系统。现有近500个数据库，专业内容涉及自然科学、社会科学、工程技术、人文科学、时事报道和商业经济等各个领域，是一个综合性的检索系统。其绝大部分数据库都是由专门的数据库提供商提供的

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3，优基泰是做什么的

优基泰是联合基因集团旗下的电商品牌。主要为面向个人及团体提供疾病易感基因检测、儿童天赋基因检测、个性化用药指导等基因检测健康管理服务。母公司联合基因集团在业内知名的生物技术企业。联合基因集团97年11月发源于复旦大学，由毛裕民教授、谢毅教授等一批教授创立的高科技生物技术企业。创立伊始由100万起步，到2005年底，已经形成资产超过15亿，拥有20多家企业（包括一家上市公司）的基因技术企业集团。基因检测业务市场占有率达90%以上。创立以来，集团先后投入基因技术研发费用超过6亿元，创造了一系列的中国第一，包括：建立了中国第一个大规模人类基因数据库研制成功中国第一块基因芯片建立了国内第一个基于基因分析技术的新药筛选平台建立了国内第一套基因检测企业技术标准基因检测技术平台在行业内第一家通过“中国合格评定国家认可委员会（CNAS）认可” 拥有世界上最大的黄种人疾病易感性基因数据库拥有国内最大规模的基因技术平台目前，集团的产业涉及基因技术及相关产品开发、生物制药、基因检测及个人健康管理、科技园区开发和房地产、计算机及软件、教育培训、金融资本管理等多个产业领域。麻烦采纳，谢谢!

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4，小鼠circrna数据库齐全吗

1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标。

随着对circrna研究的越来越多，已知的circrna数据信息在快速增长，在这里我们肽度时界（timedoo）整理了当前circrna相关的数据库列表，希望能帮到您：1.circbase[1]，是一个通过收集和整合已经发布的circrna数据构建的数据库。目前该数据库收集包括以下6个物种的circrna信息：人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latcha1)、腔棘鱼 (latcha1)。该数据库最新版本发布时间为2014年1月。网址：http://www.circbase.org/。通过在搜索界面中的list search提交circbase支持的circrna id号或基因组区域位置信息，可以快速查询相关circrna信息；研究者也可以通过tablebrowser进行条件设置，筛选自己所需要的circrna数据。2.circrnabase[2] , 该数据库通过整合已发表的circrna数据，构建mirna与circrna以及circrna与rna结合蛋白（rbp)的互作网络。最新版本发布时间：2013年12月。网址：http://starbase.sysu.edu.cn/mircircrna.php3.circ2traits[3] ，是一个收集与人类疾病或性状潜在关联的circrna数据库。该数据库通过预测mirnas和人类的蛋白质编码基因、长链非编码基因及环状rna间的相互作用关系，构建了相互作用网络,　并对mirnas-circrna相互作用组中的蛋白编码基因进行了go富集分析；此外，将与疾病相关的snps位点定位到circrna基因座上，并鉴定了环状rnas上的ago相互作用位点。最新版本发布时间：2013年12月。网址：http://gyanxet-beta.com/circdb/4.circnet[4]，利用464个rna-seq测序数据，进行新circrna预测及基因组注释，并计算已知的及新预测的circrna表达情况，构建circrna-mirna-genet调控网络，以上信息均可从该数据库获得。版本发布时间：2015年12月。网址：http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/5.deepbase v2.0[5]平台, 该数据平台收集了大约15万多的circrna基因（人、鼠、果蝇、线虫等），并构建了最全面的circrna的表达图谱。最新版本发布时间：2015年10月网址：http://deepbase.sysu.edu.cn/6.circinteractome[6]该数据库预测了已知的109个rna结合蛋白数据集与circbase中的circrna的结合位点，并利用targetscan软件预测了mirnas与circrna的潜在结合位点。最新版本发布时间：2015年12月网址：http://circinteractome.nia.nih.gov/你也可以上肽度时界（timedoo）查看circrna（环状rna）学术解读资料。

5，哪个数据库能找到已经被验证的与特定疾病有关的mirna

这里有一个软件：miRTarBae，不错！它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA，即可找到验证了的靶基因。靶基因在Wikipedia就可找到它的功能！目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3（Suppressor of cytokine signaling 3）

1、starbase一个高通量实验数据clip-seq（或称为hits-clip,par-clip,iclip）和mrna降解组测序数据支持的microrna靶标数据库,包含了mirna-mrna，mirna-lncrna，mirna-circrna，mirna-cerna 和rna-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间：2013年11月。2、mirbase众所周知的microrna基因注释数据库。目前mirbase只提供了microrna的靶标的预测软件的链接（如：pictar）。最新版本发布时间：2010年9月。3、chipbase整合clip-seq和chip-seq的数据探讨microrna的转录和转录后调控，构建转录因子->microrna->靶标的调控网络。最新版本发布时间：2012年11月。4、tarbase一个收集已被实验验证的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2009年1月。5、mirecords一个整合的microrna靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间：2010年11月。6、targetscan基于靶mrna序列的进化保守等特征搜寻动物的microrna靶基因。是预测microrna靶标假阳性率较低的软件。而且是microrna领域大牛bartel实验室开发的。最新版本发布时间：2009年4月。7、pictar基于microrna或microrna靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microrna靶基因。假阳性率也较低。是microrna领域大牛rajewsky实验室开发的。最新版本发布时间：2007年3月。8、pita基于靶位点的可接性和自由能预测microrna的靶标。是著名的生物信息学家segal实验室开发的。最新版本发布时间：2008年8月。9、rna22基于序列特征预测microrna的结合位点。是几个流行的microrna靶标预测软件的其中一个。ibm公司的研究团队开发的。最新版本发布时间：2007年。10、miranda和microrna.org是著名的memorialsloan-kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。miranda的最新版本又叫mirsvr。最新版本发布时间：2010年8月。11、microcosmembl-ebi的enright 实验室开发的microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2010年8月。12、mirtarbase整合实验证实的microrna靶标的数据库。最新版本发布时间：2010年10月。13、mirgator v2.0整合microrna表达、靶标和疾病相关信息的数据库。最新版本发布时间：2010年11月。14、mirnamap动物的microrna基因及其靶标的数据库。最新版本发布时间：2008年1月。15、mirdb动物microrna靶标预测和功能注释数据库。最新版本发布时间：2010年8月。16、rnahybrid一个基于mirna-target配对自由能预测microrna的靶标。最新版本发布时间：2011年6月。17、mirgenmicrorna基因和microrna靶标数据库。最新版本发布时间：2007年1月。