tcga有哪些数据库，如何快速掌握TCGA数据库

本文目录一览

1，如何快速掌握TCGA数据库
2，关于TCGA数据库的问题新手求助
3，哪位会用TCGA数据库查找数据啊求大神指点跪谢
4，如何使用TCGA数据库做生存分析
5，如何使用tcga

1，如何快速掌握TCGA数据库

tcga工作组发的文章。The Cancer Genome Atlas （TCGA，数据库。TCGA数据源大部分都是公开的。目前来能够从TCGA数据库中提取数据的处理工具有cBioPortal ），ICGC（和GenePattern（

如何快速掌握TCGA数据库

2，关于TCGA数据库的问题新手求助

这种东西是看不出来是否判断与肿瘤有关的，肿瘤本身具有远端转移特性，从各个组织中都有可能存在。所以如果想要看pathway是否与肿瘤相关，就需要点进去查看相关文献，把各种蛋白摸透，才能够搞定，如果仅仅凭借go数据库的pathway来的就能判断了

关于TCGA数据库的问题新手求助

3，哪位会用TCGA数据库查找数据啊求大神指点跪谢

你的数据库没有连接上。检查一下你的连接串的内容是否正确。你是不是用自带的sqlexpress来做数据库？如果是的话，试一下把连接串改成：string constr = "server=.\sqlexpress;database=da;user id=sa;password=1234 intergrated security=false;";--------------我漏了看了，你的insert 语句错了。好好学一下sql的写法。

1. Ctrl-W2. Ctrl-T4.About the Data 左键单击5. ：User Guides and Help 左键单击6. Be patient....

哪位会用TCGA数据库查找数据啊求大神指点跪谢

4，如何使用TCGA数据库做生存分析

DataTable dt = new DataTable();dt.Columns.Add(new DataColumn("PreRevDate0", typeof(decimal)));DataColumn col = new DataColumn();col.ColumnName = "PreRevDate1";col.Expression = "ABS(Convert.ToInt32(PreRevDate0))";col.DataType = typeof(decimal);dt.Columns.Add(col);DataRow dr = dt.NewRow();dr["PreRevDate0"] = -1;dt.Rows.Add(dr);

5，如何使用tcga

TCGA数据库发展很快，使用频繁，可以发到不错的文章，TCGA数据库包含的内容非常多，下载资料的方式也是非常独特。临床数据，基因数据，miRNA数据，下载这些数据做差异分析，然后做生存分析是比较常见的方法。如果下载，如何整体，我们有相关的方法，这里不能发链接，你需要进去我的百度页面，进入我们的网页，可以学到很多TCGA的数据挖掘信息。希望对你有帮助

2013-01-11 06:34tcga原始数据下载方法1, 安装genetorrent-3.3.4-ubuntu11.x86_64.tar.gz2, 安装cgquery-2.1.3.tar.gz3, 进入https://browser.cghub.ucsc.edu4, 选择生成manifest.xml或者用cgquiry生成xml5, 向nih购买credential6, cgquery "xml_text=\"library_strategy>rna-seq\"&disease_abbr=luad&state=live -o myquery.xml7, gtdownload -c /path/to/mykey.pem -d /path/to/myquery.xml -v -c /path/to/genetorrent/ -p /path/to/savedata/ ok,现在你就得到tcga海量的原始测序文件了. 注意如果你之前add something into the cart, you should remove them.