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转录组数据库有哪些,什么是转录组文库

来源:整理 时间:2024-12-29 15:11:42 编辑:黑码技术 手机版

本文目录一览

1,什么是转录组文库

转录组文库就是将生物体所有转录产物(mRNA)逆转录后接入适当载体构成的文库。包含全部转录信息。

什么是转录组文库

2,转录组有多个数据库注释以哪个为准

Oracle 和 SQL Server: 单行 --这后边就是注释 多行 /* 这里是注释 这里是第二行注释 */

转录组有多个数据库注释以哪个为准

3,数据库有哪些

常见的数据库.如ACCESS,MSSQL,MYSQL,ORACLE,DB2.一般前三个用得多一点.ACC用于一般的企业网站.数据量小.访问量小.后两个,用于大点的网站.在效率上会比ACC要高.最后两个,一般都是大型的应用平台才会用到.当然,还会有其它的数据库.但一般用得少.

数据库有哪些

4,求基因表达常用数据库

IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID,OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号(Havana transcript)。http://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891UCSC Microarray Expression Data 给出了基因mRNA在人类不同组织中的表达量http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGene?hgg_gene=uc001hmc.2&hgg_prot=B2RPG8&hgg_chrom=chr1&hgg_start=220267454&hgg_end=220321376&hgg_type=knownGene&db=hg19&hgsid=193781719GEO数据库给出了详细的基因mRNA在不同组织中的表达数据,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/基因的表达量不等于转录本的表达量,特定转录本IARS2-003的表达量需要自行实验证明。
应该有这类数据库。自己找找。最好看文献。再看看别人怎么说的。
你这是什么问题啊,汗,都看不懂
http://www.geneticsofgeneexpression.org/network/

5,nosql数据库有哪些

这个范围太广了,太多了,而且很多数据库不是纯nosql,给你列几个比较著名的吧。DynamoDBBerkeley DBMongoDBHyperGraphDBArangoDBGemFireEMC Documentum xDB等等等等
nosql太火,冒出太多产品了,保守估计也成百上千了。互联网公司常用的基本集中在以下几种,每种只举一个比较常见或者应用比较成功的例子吧。1. in-memory kv store : redisin memory key-value store,同时提供了更加丰富的数据结构和运算的能力,成功用法是替代memcached,通过checkpoint和commit log提供了快速的宕机恢复,同时支持replication提供读可扩展和高可用。2. disk-based kv store: leveldb真正基于磁盘的key-value storage, 模型单一简单,数据量不受限于内存大小,数据落盘高可靠,google的几位大神出品的精品,lsm模型天然写优化,顺序写盘的方式对于新硬件ssd再适合不过了,不足是仅提供了一个库,需要自己封装server端。3. document store: mongodb分布式nosql,具备了区别mysql的最大亮点:可扩展性。mongodb 最新引人的莫过于提供了sql接口,是目前nosql里最像mysql的,只是没有acid的特性,发展很快,支持了索引等特性,上手容易,对于数据量远超内存限制的场景来说,还需要慎重。4. column table store: hbase这个富二代似乎不用赘述了,最大的优势是开源,对于普通的scan和基于行的get等基本查询,性能完全不是问题,只是只提供裸的api,易用性上是短板,可扩展性方面是最强的,其次坐上了hadoop的快车,社区发展很快,各种基于其上的开源产品不少,来解决诸如join、聚集运算等复杂查询。
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